Empezó en el Colegio Amorós con el deporte nacional de España, porque en su casa lo único que había eran balones de fútbol. Elisa era la pequeña de tres hermanos, junto con el cabeza de familia Don Mariano Aguilar (e inclusive tíos), todos ellos futbolistas. En aquel momento la pequeña de la saga Aguilar quiso seguir los pasos, hasta que un buen día Doña Paquita (madre de la cual su hija procesa gran admiración) precisó en buscar otro deporte.

Así se inicio Elisa en el baloncesto con nueve años, dotes que pronto brotarían a la luz para continuar su progresión dos años más tarde en el Real Canoe N.C. donde estuvo hasta los 20 años y en donde realmente se formó como jugadora y como persona, «sólo tengo buenas palabras para ese Club» confiesa la madrileña.

Elisa debutó en la Liga Femenina con 16 años con el Canoe, recreando tiempos de gloria del Club madrileño quedando subcampeona de Liga y conquistando la Copa de la Reina celebrada en Huesca.

Cambio de aires alzando el vuelo a Estados Unidos donde estudió en la Universidad de George Washington, jugando tres años y medio. La madrileña se convirtió en una habitual de las páginas deportivas del `The Washington Post´. En uno de los encuentros su equipo pasaba por serias dificultades en la recta final del partido y en menos de treinta segundos la base encestó tres triples de forma consecutiva, rompiendo el encuentro a su favor. Su entrenador Joe Mc Keown comentó su asombro «Pocas veces había visto algo así. Las grandes jugadoras lo demuestran cuando más se las necesitan, y eso es lo que ha hecho Elisa». Fue Rookie del año y en la última temporada formó parte del All Star de la liga de la universidad, encontrándose dentro de las 20 mejores jugadoras, «fue una experiencia muy positiva» dice la jugadora que superó los 1.000 puntos y 300 asistencias en la universidad.

La base retornó a España para recalar una temporada en el Halcón Viajes de Salamanca quedando subcampeona de la Copa de la Reina «Aquel año fue especial, fue mi primera temporada en España con un equipo de verdad. Nunca he visto una armonía tan perfecta» declaraba Elisa. Además logró la medalla de bronce en el Europeo de Francia para seguir en la Liga Femenina (temporada 2001/02), con el Caja Rural Canarias.

El verano volvía a llegar sin descanso para Aguilar que cruzó el charco para jugar en la mejor liga del mundo, la WNBA, con Utah Starzz, siendo una de las pocas españolas en conseguirlo. Más tarde ficharía por el campeón Ros Casares de Valencia equipo y ciudad en la que Elisa se siente como en casa.